Ubuntu9.04/9.10にanapawをインストールする方法のメモ

東京工業大学＞大学院理工学研究科＞基礎物理学専攻＞中村研究室＞メンバー＞ Takayuki Sako ＞

Ubuntu9.04/9.10にanapawをインストールする方法のメモ

概略

Ubuntu9.04に竹内氏のページからダウンロードしたANAPAW v.2.3.1をインストール
↓
色々頑張る。
↓
とりあえず動く。ただし、a/lすると落ちる。hbkは読める。要するに解析に使えない。
↓
しばらく放置。g77を自前でビルド。この間にUbuntu9.10へアップグレード。
↓
Ubuntu10.4@Asにインストールが完了したANAPAW(RIBF ver)を丸ごとコピー。ビルド。
↓
ridfは多分OK。ただしrdfがアウト。色々エラーが出る。
↓
cshの代わりにtcshを使う。RIBFでないverもうまくビルドできた。rdfもちゃんと読み込める。一件落着。

以下、その時々のメモ。

adduser

普段のユーザーとは別にanapaw用にadduserでユーザーを追加。今回、ユーザー名はripsとした。

インストール開始

小林氏のページを参考にインストール開始。makelibの手前まではうまく行く。この先は色々問題発生。

permission denied

この状態でmakelibをするとpermission deniedと出る。ripsがファイルやディレクトリの所有者となっていない。

~/usr/local/anapaw_v2-3-1/src$ ls -lt

で確認。

~/usr/local/anapaw_v2-3-1/src$ sudo chown rips:rips *

で所有者を変更する。さらに必要に応じて

sudo chmod +x [file name]

などで権限の変更を行う。

…
-rw-r--r-- 1 rips rips 2692 2009-10-06 18:54 astop.o
-rw-r--r-- 1 rips rips 8348 2009-10-06 18:54 ainit.o
-rw-r--r-- 1 rips rips 71788 2009-10-06 18:54 anamnu.o
-rw-r--r-- 1 rips rips 2279 2009-10-06 18:53 Makefile
lrwxrwxrwx 1 rips rips 16 2009-09-25 15:40 anaevent.f -> anaevent_riken.f
lrwxrwxrwx 1 rips rips 16 2009-09-25 15:40 common.inc -> common_riken.inc
lrwxrwxrwx 1 rips rips 16 2009-09-25 15:40 dumpdata.c -> dumpdata_riken.c
lrwxrwxrwx 1 rips rips 16 2009-09-25 15:40 getblock.c -> getblock_riken.c
lrwxrwxrwx 1 rips rips 14 2009-09-25 15:40 getevt.c -> getevt_riken.c
-rw-r--r-- 1 rips rips 2289 2005-02-09 05:05 anaevent_nscl.f
-rw-r--r-- 1 rips rips 2562 2005-02-09 05:05 anaevent_riken.f
…

こんな感じになればOK

g77

makelib
make: ディレクトリ `/home/rips/usr/local/anapaw_v2-3-1/src' に入ります
make anaclean
make[1]: ディレクトリ `/home/rips/usr/local/anapaw_v2-3-1/src' に入ります
rm -f *~ *.o *.f~ *.c~ *.a /home/rips/usr/local/anapaw/lib/anapaw.o \
/home/rips/usr/local/anapaw/lib/libanalib.a
make[1]: ディレクトリ `/home/rips/usr/local/anapaw_v2-3-1/src' から出ます
make -C /home/rips/usr/local/anapaw/src/vana clean
make[1]: ディレクトリ `/home/rips/usr/local/anapaw_v2-3-1/src/vana' に入ります
rm -f viewana *.o *.c~
make[1]: ディレクトリ `/home/rips/usr/local/anapaw_v2-3-1/src/vana' から出ます
make: ディレクトリ `/home/rips/usr/local/anapaw_v2-3-1/src' から出ます
make: ディレクトリ `/home/rips/usr/local/anapaw_v2-3-1/src' に入ります
g77 -O2 -funroll-loops -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE_SOURCE -c anamnu.f
make: g77: コマンドが見つかりませんでした
make: *** [anamnu.o] エラー 127
make: ディレクトリ `/home/rips/usr/local/anapaw_v2-3-1/src' から出ます
make: ディレクトリ `/home/rips/usr/local/anapaw_v2-3-1/src' に入ります
make viewana
make[1]: ディレクトリ `/home/rips/usr/local/anapaw_v2-3-1/src' に入ります
make -C /home/rips/usr/local/anapaw/src/vana
make[2]: ディレクトリ `/home/rips/usr/local/anapaw_v2-3-1/src/vana' に入ります
gcc viewana.c -I/usr/include -L/usr/lib -lX11 -lXt -lXaw -o viewana
make[2]: ディレクトリ `/home/rips/usr/local/anapaw_v2-3-1/src/vana' から出ます
make[1]: ディレクトリ `/home/rips/usr/local/anapaw_v2-3-1/src' から出ます
mv anapaw.o /home/rips/usr/local/anapaw/lib/anapaw.o
mv: stat `anapaw.o'を実行できません: No such file or directory
make: *** [install] エラー 1 make: ディレクトリ `/home/rips/usr/local/anapaw_v2-3-1/src'

g77が入っていない。入れてみる。

~$ sudo apt-get install g77
パッケージリストを読み込んでいます... 完了
依存関係ツリーを作成しています
状態情報を読み取っています... 完了
パッケージ g77 はデータベースには存在しますが、利用できません。
おそらく、そのパッケージが見つからないか、もう古くなっているか、
あるいは別のソースからのみしか利用できないという状況が考えられます
E: パッケージ g77 にはインストール候補がありません

sudo apt-get install する際のダウンロード先を以下のように変更

「システム」－「システム管理」‐「ソフトウェア・ソース」 →「ダウンロード先」を「日本のサーバ」から「メインサーバ」へ

するとg77がインストールできるらしい記述を見かけたがサーバを変更してもg77はインストールできなかった。
どうやらubuntu9.04にはg77が入らないらしい。そこでgfortranを使うことにする (fort77を試すと大量のエラーが出るので諦めた)。
エラーメッセージを見ながらmakefile中のg77をgfortranへ書き換える。

※追記
この後自前でg77をビルドすることによりANAPAWのインストールに成功した。

ff2c

makeanaをするとC関係のエラーが発生する。

~/usr/local/anapaw/src/Makefile

中に

FFLAGS = -O2 -funroll-loops -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE_SOURCE -ff2c

-ff2cを追加。するとエラーを回避できる。
後は、再度小林氏のページを参考にしながらlibreadline libncursesのリンクを作るとmakeanaまでエラーなく実行可能。

X

この段階で一応anapawは起動できるものの

***** ERROR in IOPWK : Can't open DISPLAY
***** ERROR in IACWK : Workstation is not open
***** ERROR in ISWKWN : Invalid workstation window parameters
***** ERROR in ISWKVP : Invalid workstation window parameters

なるエラーが出る。

sudo login rips

でripsにログインしている限りデフォルトではXが起動できない。そこで

ssh -X rips@host

としてsshを使うとうまく行く。詳細は知らない。

この段階のまとめ

ANAPAW v.2.3.1 (RIBFでないバージョン)@Ubuntu9.04
gfortran使用
csh使用
ANAPAWの起動は可能
hbkを読み込むことは可能
a/lでANAPAWが落ちる。つまり、解析ができない

ANAPAW放置

しばらくANAPAW放置。この間にg77を自前でコンパイル。このメモは紛失。ただ、gcc-2.95.3でコンパイルした模様。
さらにこの時期Ubuntu9.10へアップグレード。

ANAPAW(RIBF ver)

K.T君がUbuntu10.4@AsにDAYONEのRIBF verのANAPAWをインストールした。インストール完了後、丸ごとコピーしてビルドする姑息な作戦。ちなみにANAPAW本体のソースは

~/usr/local$ ls
anapaw anapaw_ridf anapaw_v2-3-1

においてリンクを張り替えて両者を使い分ける(このディレクトリのanapawはただのシンボリックリンク)。RIBFバージョンをanapaw_ridfとしてこちらを使うときは

ln -s anapaw anapaw_ridf

としておく。 makeanaすると

g77 -o anapaw usersrc.o usersub.o add_ntuple.o int2char.o util.o encppac.o loadppacprm.o calc_ppac.o rayfit.o encpla.o loadplaprm.o encrf.o loadrfprm.o encssd.o loadssdprm.o encic.o loadicprm.o encnai.o loadnaiprm.o rec_delta.o rec_beta.o encpid_bigrips.o encpid_zds.o physutil.o loadpidbigripsprm.o loadbigripsmat.o encf11ge.o encf7ge.o clover.o loadf7geprm.o loadf11geprm.o loadpidzdsprm.o loadzdsmat.o read_mat.o encdali.o loaddaliprm.o enccoin.o rnum2filename.o loadicoffset.o /home/rips/usr/local/anapaw/lib/anapaw.o /home/rips/usr/local/anapaw/lib/libanalib.a -L/usr/lib -lX11 -ldl -lcrypt -L/home/rips/usr/local/anapaw/lib -lanalib -lXt -lXaw -lpthread -L/usr/lib -lpawlib -lgraflib -lgrafX11 -lpacklib -lmathlib -lkernlib -Icern -lnsl -lreadline -lncurses -lstdc++ -llapack -lblas
/usr/bin/ld: cannot find -lstdc++
collect2: ld returned 1 exit status
make: *** [anapaw] エラー 1
make: ディレクトリ `/home/rips/exp/dayone/users/dayone/src' から出ます

lstdc++が見つからないというエラーは出たもののlocateすると

locate libstdc
…
/usr/lib/libstdc++.so
/usr/lib/libstdc++.so.6
/usr/lib/libstdc++.so.6.0.13
/usr/lib/gcc/i486-linux-gnu/4.1/libstdc++.a
/usr/lib/gcc/i486-linux-gnu/4.1/libstdc++.so
/usr/lib/gcc/i486-linux-gnu/4.2/libstdc++.a
…

入っているっぽい。とりあえず適当にリンク。

ln -s /usr/bin/libstdc++.so /usr/lib/libstdc++.so

するとmakeana通った。これでridfは使えるようになった。

rdfを使いたい

RIBF仕様のridfだけでなくrdfも使いたい。そこでNEBULAのDAQ用PCに入っているsrcを移植、 makeanaするも色々エラーが出る。 src/に runstat.fhをコピー。usersrc.f に

include 'runstat.fh'

を追加。するとmakeanaは通る。だが、ANAPAWを起動すると

host:~/exp/dayone/users/nebulatest> anapaw
******************************************************
* *
* W E L C O M E to P A W *
* *
* Version 2.14/04 12 January 2004 *
* *
******************************************************
Workstation type (?=HELP) < CR>=1 :
Version 1.29/04 of HIGZ started
*** No default PAWLOGON file "/home/rips/.pawlogon.kumac" found

******************************************************
* *
* W E L C O M E to A N A P A W *
* *
* Version 2.3.1 : 09.Feb.2005 *
* *
* S.Takeuchi@RIKEN *
* *
******************************************************

ANAPAW-M : [TArtEventStore] Constructor
ANAPAW-M : [TArtEventStore] Initialize : SET ART_MAPCONFIG!!!
ANAPAW-M : [TArtMapConfig] ~TArtMapConfig

このエラーが出てANAPAWが落ちたりする。修正は手間がかかりそう。

RIBFでないバージョンを再びビルド

とりあえずcshの代わりにtcshを使う。

sudo apt-get install tcsh

すでにg77は自前でビルドしてあるので前にgfortranに書き換えたMakefileをg77に戻す。するとうまくいった。a/lもうまくいく。これで無事終了。ちなみにcshではうまくいかなかった。

謝辞

今回のanapawのインストールに際し、近藤氏・小林氏には大変お世話になりました。深く感謝申し上げます。